После весенних каникул ученики закрытой школы «Логос» возвращаются в стены учебного заведения. Бывшие враги — Максим и Андрей — теперь стали друзьями, но никто не понимает почему. Они вместе с остальными решают исследовать подземелья школы, не догадываясь к чему это может привести. В школе появляется новая учительница истории, ребята разгадывают таинственные символы, а прошлое «Логоса» еще громче стучится в двери, напоминая о себе страшными событиями. Андрей узнаёт о тайнах своей семьи, а его одноклассники сталкиваются с ужасной правдой о проекте «Гемини».